阴茎短小可通过药物内分泌治疗或手术治疗。
一、药物治疗：对于睾酮水平低下的患者，可采用促进睾酮产生的药物来促进性器官发育，主要是模拟生理状态促进性腺激素分泌，以诱导阴茎再次发育。临床可选择促性腺激素释放激素和睾酮进行治疗，但需注意男性若有前列腺恶性肿瘤或雄激素依赖性肿瘤不可使用，对绒毛膜促性腺激素过敏者也不能用。此类药物使用可能导致骨质流失，引发骨质疏松。
1.促性腺激素释放激素：通过刺激垂体前叶分泌促性腺激素，进而促进睾酮的合成与分泌。
2.睾酮：直接补充体内缺乏的睾酮，发挥作用。
二、手术治疗：药物治疗无效的患者可在青春期后考虑手术，目前临床上对阴茎牵拉长度小于7厘米的患者，可采取阴茎延长术，但手术难度较大。
总之，应在医生指导下进行诊治，不可轻信偏方验方，以免带来危险。