耳根部疼痛主要原因有以下几类情况。首先，耳部本身的疾病可能导致耳根部疼痛，比如外耳道炎，它是由细菌感染等引起，发病率较高，当炎症累及耳根部周围组织时，就可能引发耳根部疼痛。还有中耳炎，尤其是急性中耳炎，炎症刺激会牵涉到耳根部出现疼痛。
耳部疾病引发
外耳道炎：多因外耳道皮肤受损伤，细菌侵入感染所致，会有耳部疼痛，可放射至耳根部。患者会感觉耳内灼热、疼痛，严重时咀嚼、说话都会使疼痛加重。中耳炎：急性中耳炎常由上呼吸道感染引发，细菌或病毒进入中耳引起炎症，除了耳痛，还可能伴有听力下降、耳鸣等症状，疼痛可牵扯到耳根部。
颞下颌关节问题
颞下颌关节紊乱综合征：这是引起耳根部疼痛较常见的原因。长期偏侧咀嚼、咬合关系不良、精神紧张等都可能诱发。患者会感到耳根部、面部疼痛，尤其在张口、咀嚼时疼痛明显，有时还能听到关节弹响。比如一些习惯用一侧牙齿咀嚼食物的人，就容易出现这种情况。
神经方面的因素
三叉神经痛：三叉神经分布区域包括面部，当三叉神经某一支发病时，可能会导致耳根部附近疼痛。疼痛通常突发突止，呈电击样、针刺样，疼痛剧烈。比如有的患者说话、刷牙时可能触发疼痛发作，疼痛可牵涉到耳根部区域。舌咽神经痛：疼痛也可能放射到耳根部，疼痛性质类似三叉神经痛，突然发作，持续时间较短，但会给患者带来较大痛苦。
其他原因
腮腺炎：流行性腮腺炎或化脓性腮腺炎都可能引起耳根部疼痛。流行性腮腺炎是由病毒感染引起，儿童多见，除了耳根部肿胀疼痛，还伴有发热等症状；化脓性腮腺炎多因细菌感染，腮腺区红肿、疼痛，疼痛可放射至耳根部。颈部淋巴结炎：当颈部淋巴结发炎时，也可能导致耳根部疼痛。比如头颈部有炎症病灶，可引起颈部淋巴结肿大、疼痛，进而牵涉到耳根部。