一、肾脏疾病相关
1.肾小球肾炎：多种原因可引发，如感染（细菌、病毒等感染后）、自身免疫紊乱等。患者除肾部疼痛外，常伴有蛋白尿、血尿、水肿等表现。儿童患肾小球肾炎可能与链球菌感染后免疫反应有关，发病前多有上呼吸道感染等前驱症状；成年人则可能因自身免疫性疾病累及肾脏而发病。
2.肾盂肾炎：多由细菌感染引起，细菌由尿道上行感染肾盂等部位。女性由于生理结构特点，尿道短且直，更易发生肾盂肾炎，性生活、泌尿系统结石等因素可增加患病风险。急性肾盂肾炎患者会出现肾区疼痛、发热、尿频、尿急、尿痛等症状；慢性肾盂肾炎患者肾部疼痛相对较隐匿，可伴有肾功能减退等表现。
3.肾结石：尿液中的某些物质结晶沉积形成结石，移动时可损伤肾盂或输尿管黏膜引起肾部疼痛，疼痛多较剧烈，呈绞痛样，可向会阴部放射。不同年龄人群都可能患肾结石，生活方式中饮水少、高钙饮食等是常见诱因，肥胖人群患肾结石的风险可能相对较高，因为肥胖可能影响尿液成分等。
4.肾囊肿：分为单纯性肾囊肿和遗传性肾囊肿等。单纯性肾囊肿常见于成年人，一般较小的肾囊肿无明显症状，较大的肾囊肿可能压迫周围组织引起肾部胀痛等不适。遗传性肾囊肿如多囊肾，多有家族遗传史，儿童或青少年时期可能就开始出现肾脏囊肿，随着病情进展，肾囊肿逐渐增多、增大，可导致肾部疼痛、肾功能逐渐减退等。
二、肾周围组织疾病相关
1.肾周围炎和肾周围脓肿：多由邻近组织感染蔓延所致，如肾皮质感染蔓延至肾周围组织。患者除肾部疼痛外，常伴有高热、寒战等全身感染症状，疼痛可因体位改变而加重等。糖尿病患者由于自身抵抗力相对较低，发生肾周围炎和肾周围脓肿的风险可能增加，因为高血糖环境利于细菌生长繁殖。
三、其他可能原因
1.肾梗死：肾动脉或其分支栓塞或血栓形成导致肾组织缺血坏死。常见于有心房颤动等心脏疾病的患者，栓子脱落可栓塞肾动脉；动脉粥样硬化等也可能引起肾动脉狭窄、血栓形成等。患者可出现突发的肾区剧烈疼痛，常伴有血尿等表现。
2.腰部肌肉骨骼问题：虽然不是肾脏本身的疾病，但也可引起类似肾部疼痛的感觉。如腰肌劳损，长期久坐、弯腰工作等人群易患，腰部肌肉慢性损伤导致疼痛，疼痛部位可能与肾区有重叠，但通过休息、按摩等处理腰部肌肉后症状可缓解，而肾脏疾病引起的疼痛一般不会因腰部肌肉处理而缓解。腰椎间盘突出症患者，突出的椎间盘压迫神经也可能导致腰部及肾区附近疼痛，年龄较大、长期腰部负重的人群更易发生。