中医治疗生殖疱疹可通过多种方式，在辨证论治基础上有相应方法。一般来说，中医会从清热利湿、解毒散瘀等方面入手。
中药内服调理
湿热下注型： 常见症状为生殖器部位水疱、糜烂，伴有尿频、尿急、尿痛等。常用龙胆泻肝汤加减，该方中的龙胆草能清泻肝胆实火、清利肝经湿热；泽泻、木通、车前子可清热利湿，使湿热从水道排出。阴虚火旺型： 表现为疱疹反复发作，伴口干咽燥、五心烦热等。常用知柏地黄丸加减，知母、黄柏能滋阴降火，熟地黄、山茱萸等可滋补肝肾之阴。
外治法运用
中药外洗： 可选用苦参、黄柏、野菊花等中药煎水外洗，苦参有清热燥湿、杀虫止痒之功，黄柏能清热燥湿、泻火解毒，野菊花可清热解毒。一般每天外洗1 - 2次，能缓解局部疱疹引起的瘙痒、疼痛等不适。中药敷贴： 对于疱疹破溃者，可用青黛散等外敷，青黛散有清热解毒、消肿止痛的作用，能促进创面愈合，减轻炎症反应。
针灸辅助治疗
体针疗法： 根据不同证型选取相应穴位。湿热下注型可选取阴陵泉、行间、大敦等穴位，阴陵泉能健脾利湿，行间、大敦可清泻肝火；阴虚火旺型可选取太溪、三阴交、关元等穴位，太溪能滋阴补肾，三阴交可滋补肝肾，关元有补益元气的作用。通过针刺这些穴位，调节人体气血阴阳平衡，达到治疗生殖疱疹的目的。耳针疗法： 选取生殖器、内分泌、皮质下等耳穴，通过针刺或埋豆等方法刺激耳穴，调节机体的免疫功能和内分泌功能，辅助治疗生殖疱疹，一般每周可进行2 - 3次耳针治疗。
生活调护配合
饮食方面： 患者应避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，如辣椒、油炸食品、酒类等，这些食物容易加重体内湿热，不利于病情恢复。宜多吃清淡、富含维生素的食物，如新鲜蔬菜、水果等。作息方面： 要保证充足的睡眠，避免熬夜。因为长期熬夜会影响人体的免疫系统，导致机体抵抗力下降，容易使生殖疱疹复发或加重病情。一般建议每天保证7 - 8小时的睡眠时间。情绪方面： 保持心情舒畅，避免焦虑、紧张等不良情绪。情绪波动过大也会影响人体的内分泌和免疫功能，对生殖疱疹的治疗产生不利影响。患者可通过适当的运动、听音乐等方式缓解压力，调节情绪。