舌头下面长了个小肉芽并伴有疼痛，可能是以下原因引起：
1.口腔溃疡：口腔溃疡是一种常见的口腔黏膜溃疡性损伤，可能由局部创伤、精神紧张、食物、药物、营养不良、激素水平改变等因素引起。溃疡通常呈圆形或椭圆形，表面覆盖有一层黄色假膜，周围有红晕，伴有明显的疼痛。治疗方法包括局部使用口腔溃疡贴片、漱口水等，同时注意口腔卫生，避免刺激性食物。
2.舌下腺囊肿：舌下腺囊肿是由于舌下腺导管堵塞，分泌物潴留引起的囊性肿物。囊肿位于舌下区，呈浅蓝色，扪之柔软有波动感。常发生于儿童和青少年。治疗方法主要为手术切除。
3.口腔乳头状瘤：口腔乳头状瘤是由人乳头瘤病毒感染引起的口腔黏膜良性肿瘤。肿瘤呈乳头状或菜花状，可有蒂或无蒂。常发生于儿童和青年人。治疗方法主要为手术切除。
4.舌炎：舌炎是指舌头发生的炎症，可能由感染、过敏、营养不良、维生素缺乏等因素引起。舌炎可表现为舌头红肿、疼痛、糜烂、溃疡等。治疗方法包括去除病因、补充维生素、抗感染等。
5.其他：舌头下面长了个小肉芽并伴有疼痛还可能是其他口腔疾病引起，如口腔白斑、口腔扁平苔藓等。
如果舌头下面的小肉芽持续不愈或伴有其他症状，建议及时就医，进行详细的口腔检查和诊断，并根据具体情况进行相应的治疗。同时，要注意保持口腔卫生，避免食用辛辣、刺激性食物。