手指甲凹陷的原因包括遗传因素、营养缺乏、手部湿疹等，处理方法需根据具体病因来选择，具体如下：
一、遗传因素：如果父母中有一方或双方存在指甲凹陷情况，可能遗传给下一代。这种情况通常不会对身体健康造成影响，无需特殊处理。
1.特点：单纯因遗传导致的指甲凹陷，一般不会伴有其他不适症状。
二、营养缺乏：营养摄入不足时，可能使指甲变脆、变软，进而引起手指甲凹陷。
1.饮食改善：可在饮食中增加鸡蛋、牛奶、瘦肉等营养丰富的食物。
2.药物治疗：可遵医嘱服用复合维生素B片、复方硫酸亚铁叶酸片等药物。
(1)复合维生素B片：能补充多种维生素B，有助于改善指甲状况。
(2)复方硫酸亚铁叶酸片：可补充铁等元素，改善因相关营养缺乏导致的指甲问题。
三、手部湿疹：可能导致指甲周围皮肤出现湿疹、皮炎等，影响指甲生长，引起手指甲凹陷。
1.药物选择：可采用新霉素氟轻松乳膏、丁酸氯倍他松乳膏等药物进行治疗。
(1)新霉素氟轻松乳膏：具有抗炎、抗过敏等作用。
(2)丁酸氯倍他松乳膏：可减轻炎症反应。
此外，还不能排除甲癣等疾病的可能，需到医院完善相关检查，以明确具体发病原因，进而进行规范化治疗。总之，对于手指甲凹陷的情况，要明确原因后采取合适的处理方法。