肠道益生菌种类较多，常见的有以下几类。首先，双歧杆菌属是重要的一类，其中婴儿双歧杆菌在婴儿肠道中较为常见，它有助于维持肠道正常菌群平衡，促进消化吸收。嗜酸乳杆菌也是常见的益生菌，它能在肠道内定植，抵御有害菌入侵，对改善肠道功能有一定作用。
乳杆菌属益生菌
嗜酸乳杆菌： 能够在肠道内生长繁殖，帮助分解糖类产生乳酸，降低肠道pH值，抑制有害菌的生长。它对肠道的酸碱平衡调节有积极作用，可改善因肠道菌群失调引起的腹泻等问题。干酪乳杆菌： 可以产生一些抗菌物质，抑制 pathogenic bacteria（病原菌）在肠道的定植，同时有助于增强肠道的免疫功能，提升肠道自身的防御能力。
双歧杆菌属益生菌
长双歧杆菌： 主要存在于肠道中上部，能与肠道黏膜紧密结合，形成生物屏障，阻止有害菌黏附。它参与肠道内多种营养物质的代谢，比如促进维生素的合成等。短双歧杆菌： 在调节肠道菌群、缓解便秘方面有一定效果，它可以增加肠道的蠕动，帮助粪便排出，维持肠道正常的排便功能。
酵母菌属益生菌
布拉酵母菌： 它不同于细菌益生菌，是一种酵母菌。布拉酵母菌能在肠道内定植，调节肠道菌群的生态平衡，对一些因肠道菌群紊乱导致的腹泻有较好的改善作用，而且它不受抗生素的影响，在患者使用抗生素期间也可使用来维持肠道菌群稳定。产朊假丝酵母菌： 可以参与肠道内的物质代谢过程，帮助分解一些复杂的营养成分，辅助肠道进行消化吸收，同时对肠道内的微生态环境起到一定的调节作用。