扁平湿疣是二期梅毒的典型表现之一，治疗主要以驱梅治疗为主。一般采用青霉素类药物进行驱梅治疗，如水剂青霉素G，每天剂量240万-480万单位，分3-4次静脉滴注，连续10-14天。
药物治疗方面
青霉素类药物： 青霉素是治疗梅毒的首选药物，它可以有效杀灭梅毒螺旋体。常用的有苄星青霉素，不过对于扁平湿疣患者，通常先采用水剂青霉素进行初始治疗。其他替代药物： 如果患者对青霉素过敏，可以考虑使用头孢曲松钠等药物替代，但需要在医生的严格评估下使用。
局部护理注意事项
保持局部清洁： 患者要注意保持扁平湿疣部位的清洁干燥，每天可以用温水轻轻清洗患处，避免搔抓，防止继发感染。清洗时动作要轻柔，以免导致疣体破损。避免刺激： 要避免局部受到摩擦、热水烫洗等刺激，穿着宽松、柔软的衣物，减少对患处的摩擦。
治疗后的随访
定期复查： 在治疗后需要定期进行复查，一般治疗后的第1个月、3个月、6个月、9个月、12个月都要进行血清学检查，观察梅毒螺旋体抗体滴度的变化情况。通常经过规范治疗后，抗体滴度会逐渐下降。性伴侣同时检查治疗： 扁平湿疣患者的性伴侣也需要同时进行检查和治疗，因为梅毒主要通过性接触传播，如果性伴侣未同时治疗，很容易再次感染。