扁平湿疣是二期梅毒的表现之一，治疗主要采用抗生素疗法。一般来说，青霉素是治疗扁平湿疣的常用药物，如苄星青霉素，通常需要肌肉注射。
抗生素治疗为主
青霉素类药物： 苄星青霉素是常用的治疗药物，通过肌肉注射给药。对于青霉素过敏的患者，可选用头孢曲松等药物替代，但使用前需先进行过敏测试。
注意个人卫生与隔离
个人卫生清洁： 患者要保持病变部位的清洁干燥，每天用温水清洗患处，避免搔抓，防止自身传染或传染他人。清洗用品要单独使用，不与他人共用毛巾、浴盆等。隔离措施： 在治疗期间，患者的衣物、床单等要进行单独清洗和消毒，避免与他人密切接触，尤其是性生活方面要严格避免，防止疾病传播。
治疗后的随访复查
定期复查： 经过治疗后，患者需要定期到医院进行复查，一般在治疗后的1个月、3个月、6个月、9个月、12个月分别进行血清学检查等，观察梅毒螺旋体抗体的变化情况，以评估治疗效果和是否有复发的可能。如果复查发现异常，需要及时调整治疗方案。性伴侣同时检查治疗： 扁平湿疣患者的性伴侣也需要同时进行检查和治疗，即使没有症状也不能忽视，因为梅毒可以通过性接触传播，避免再次感染和疾病的反复。