肾绞痛主要是由于尿路结石移动，刺激输尿管平滑肌痉挛所致。比如，约90%的肾绞痛是由肾结石引起的，当结石在肾盂或输尿管内移动时，会导致输尿管平滑肌强烈收缩，从而引发剧烈的肾绞痛。
结石因素导致
结石大小与形状： 较小的结石在尿路中移动时，更容易刺激输尿管产生痉挛。比如直径小于0.6厘米的结石，相对更易在尿路内活动，引发肾绞痛的几率较高。而形状不规则的结石，对尿路黏膜的刺激更为明显，也更易导致肾绞痛发作。结石成分： 不同成分的结石引发肾绞痛的情况有所不同。例如，尿酸结石、草酸钙结石等相对更易在尿路中形成并移动，从而增加肾绞痛的发生风险。尿酸结石患者由于尿液中尿酸浓度过高，容易形成结石，在结石移动时就容易出现肾绞痛。
尿路梗阻相关
输尿管狭窄： 先天性的输尿管狭窄或者后天因炎症、手术等导致的输尿管狭窄，会使尿液排出受阻。当尿液积聚，压力升高时，就容易引发肾绞痛。比如先天性输尿管狭窄的患者，从幼年时期就可能存在尿路梗阻的隐患，随着年龄增长，可能会出现肾绞痛症状。肾盂输尿管连接部梗阻： 这是一种较为常见的尿路梗阻原因，由于肾盂和输尿管连接的部位出现梗阻，尿液排出不畅，肾脏产生的尿液积聚，进而引起肾内压力增高，导致肾绞痛发生。这种梗阻可能是先天性的发育异常引起，也可能是后天病变导致。
感染因素影响
尿路感染引发： 当尿路发生感染时，炎症会刺激输尿管等尿路组织，导致输尿管痉挛，从而引发肾绞痛。比如急性肾盂肾炎患者，除了有发热、尿频、尿急、尿痛等症状外，往往还会伴随肾绞痛。而且，感染还可能促进结石的形成，形成恶性循环，加重肾绞痛的发生。细菌感染的作用： 一些特定的细菌，如大肠杆菌等，在尿路中繁殖感染时，会释放毒素等物质，刺激尿路黏膜，使输尿管平滑肌痉挛，最终导致肾绞痛的出现。比如大肠杆菌引起的尿路感染，容易引发输尿管的痉挛性收缩，导致剧烈的肾绞痛症状。