黑色素痣是由痣细胞聚集形成的，其形成与多种因素有关。一般来说，黑色素痣的形成是先天遗传因素和后天环境因素共同作用的结果。
遗传因素相关
基因遗传倾向： 部分黑色素痣的形成与遗传有密切关系。如果家族中有黑色素痣遗传病史，那么个体患黑色素痣的概率可能会相对较高。研究发现，某些特定的基因变异可能会增加黑色素细胞异常聚集形成痣的风险。比如，有家族性黑色素痣病史的人群，其基因中与黑色素细胞调控相关的基因可能存在潜在的突变，使得身体在发育过程中更容易出现黑色素痣。
紫外线照射影响
紫外线刺激黑色素细胞： 长期暴露在紫外线下是导致黑色素痣形成的重要后天因素。紫外线会刺激皮肤中的黑色素细胞产生更多的黑色素。当皮肤频繁受到紫外线照射时，黑色素细胞会过度活跃，大量合成黑色素，这些黑色素细胞聚集在一起就容易形成黑色素痣。例如，长时间在户外活动且不注意防晒的人，比长期在室内的人患黑色素痣的几率要高。在阳光强烈的夏季，如果没有做好防晒措施，皮肤不断受到紫外线侵袭，就会促使黑色素痣的形成。
胚胎发育时期因素
胚胎期细胞异常聚集： 在胚胎发育过程中，如果黑色素细胞在迁移过程中出现异常聚集，也会形成黑色素痣。在胚胎发育早期，黑色素细胞需要从神经嵴迁移到皮肤的不同部位。如果这个迁移过程出现紊乱，部分黑色素细胞就会在皮肤的某个区域聚集，进而形成黑色素痣。这种胚胎期的细胞异常聚集是先天性黑色素痣形成的一个重要原因，有些婴儿出生时就带有较大的先天性黑色素痣，就是因为胚胎发育时黑色素细胞聚集异常导致的。