手指头缝里起小水疱的原因较多，主要包括以下几种：
一、过度摩擦
手指头持续进行活动，导致局部皮肤受到摩擦，从而出现起水疱、瘙痒、刺痛等症状。通常无需过度担心，可使用温水清洗，同时要多注意休息，避免过度劳累。
二、湿疹
1.通常由长期处于潮湿环境、精神紧张等因素引起。
2.患者一般会出现红斑、丘疹、水疱等症状，手指头缝里可起小水疱，还可能伴有瘙痒、渗出等情况。
3.治疗上可在医生指导下使用氯雷他定、盐酸西替利嗪等药物。
三、手癣
1.与皮肤受到真菌等致病菌入侵有关。
2.易出现脱屑、水疱、瘙痒、疼痛等症状。
3.可在医生指导下合理使用盐酸特比萘芬乳膏、伊曲康唑胶囊等药物来抑制炎症反应。
四、汗疱疹
1.由精神因素、病灶感染等因素引发的皮肤病。
2.临床上一般表现为手、脚出现剧烈瘙痒的水疱，手指头缝也可能出现，同时伴有刺痛、灼烧感等症状。
3.建议在医生指导下使用炉甘石洗剂、曲安奈德益康唑乳膏等涂抹患处进行治疗。
五、手足口病
1.是由肠道病毒引起的传染性疾病，可能与病毒感染、免疫力低下等因素有关。
2.患者可能出现口腔黏膜、手、足等部位水疱、溃疡、疼痛等症状。
3.可在医生指导下使用利巴韦林片、炉甘石洗剂等药物。
总之，手指头缝里起小水疱的原因多样，当出现这种情况时，应及时前往医院就诊，明确病因，并积极配合医生治疗，以免延误病情。