疗效个体差异大
不同患者对中药药方的反应不同，因为甲亢患者的病情严重程度、体质等存在差异，有的患者可能用药后症状改善不明显，无法精准针对个体情况发挥稳定且理想的疗效。
作用机制不明确
目前对于中药治疗甲亢的具体作用机制尚未完全清晰，难以从科学角度精准阐释其如何调节甲状腺功能、改善甲亢相关症状等，缺乏明确的药理学依据支撑。
疗程把控较难
中药治疗甲亢的疗程没有统一且精准的标准，过长的疗程可能导致患者依从性降低，过短则可能无法有效控制病情，难以找到最适宜的治疗时长来保障治疗效果与安全性平衡。
可能存在药物相互作用风险
若同时使用其他药物，中药药方有可能与西药等产生相互作用，虽然目前相关研究还在不断探索，但这种潜在风险是客观存在的，需要谨慎考虑。
特殊人群受限多
对于孕妇、儿童等特殊人群，中药药方的安全性和适用性需要严格评估，孕妇使用可能影响胎儿健康，儿童由于身体发育尚未成熟，使用不当可能带来不良影响，应用范围相对受限。