病毒疣可治愈但难除根，会反复发作或再感染。临床治疗方法主要有：
一、外用药治疗，包含氟尿嘧啶软膏、咪喹莫特软膏、干扰素软膏等。这些外用药可通过抑制病毒增殖等发挥作用。
1.氟尿嘧啶软膏：对病毒疣有一定的抑制效果。
2.咪喹莫特软膏：能调节局部免疫反应来应对病毒疣。
3.干扰素软膏：有助于增强局部抗病毒能力。
二、液氮冷冻治疗。这是目前较常用的方法，可直接破坏疣体。儿童需用棉签蘸取液氮，成年人则可直接用液氮喷枪。不过冷冻治疗后常有多种不良反应，如水泡、局部疼痛、色素脱失或色素沉着等。
三、二氧化碳激光治疗。此方法成功率较高，但仍有复发可能且可能出现并发症。其中脉冲染料激光能穿透表皮到达血管，特别适合生长快速的病毒疣。
1.二氧化碳激光治疗：直接作用于疣体进行清除。
2.脉冲染料激光治疗：针对特定情况的病毒疣有较好效果。
四、内用药物治疗，可口服左旋咪唑片、胸腺素片等。
五、免疫调节治疗。因病毒疣主要由宿主细胞免疫不能有效清除，表皮细胞被人类乳头瘤病毒感染所致，故治疗时可用念珠菌、毛癣菌属菌株等的抗原在长疣处进行注射。
总之，对于病毒疣的治疗方法多样，各有特点，需根据具体情况选择合适的治疗方式，同时要注意避免触摸患处以防破溃感染。