扁桃体发炎时，常用的药物有抗生素类和对症治疗药物等。一般来说，细菌感染引起的扁桃体发炎，使用抗生素可能更有效，比如青霉素类或头孢类抗生素，但具体用药需根据病情由医生判断，通常7天左右为一个常见的治疗周期。
一、抗生素类药物
细菌性扁桃体炎常用：如果是细菌感染导致的扁桃体发炎，常用青霉素类抗生素，如阿莫西林。不过对青霉素过敏者可选用头孢菌素类，像头孢克洛等。这些抗生素能抑制细菌细胞壁的合成，从而杀灭或抑制细菌生长。但使用这类药物前必须确认没有过敏史，且要在医生指导下使用。特殊情况抗生素选择：对于一些耐药菌感染可能需要用到大环内酯类抗生素，如阿奇霉素，但相对而言不是首选，除非有特殊情况。
二、对症治疗药物
解热镇痛药：当扁桃体发炎伴有发热、咽痛时，可使用解热镇痛药，如对乙酰氨基酚。它能通过抑制前列腺素的合成，起到解热镇痛的作用，一般成人每次服用0.3 - 0.6克，间隔4 - 6小时可重复用药，24小时内不超过2克。儿童需根据体重计算用量，要严格按照说明书或医嘱服用。还有布洛芬，也有解热镇痛效果，成人每次0.3 - 0.6克，每6 - 8小时一次，24小时不超过2.4克，儿童同样要按体重调整剂量。局部用药：可以使用含漱液，如复方硼砂含漱液，能清洁口腔、杀菌消炎，缓解扁桃体发炎引起的不适。使用时取适量含漱，一日数次。也可以用碘喉片等含片，含服后能直接作用于扁桃体局部，起到消炎止痛的作用，但儿童使用时要注意避免误吞。
三、病毒感染时的用药
病毒性扁桃体炎为主：如果是病毒感染引起的扁桃体发炎，一般不需要使用抗生素，可使用一些清热解毒的中成药，如蓝芩口服液。它能清热解毒、利咽消肿，缓解咽痛、咽干等症状。还有蒲地蓝消炎口服液，也有清热解毒、抗炎消肿的作用，儿童服用时要根据年龄和体重调整剂量。但病毒性扁桃体炎有自限性，一般病程在1 - 2周左右，用药主要是缓解症状。需要注意的是，扁桃体发炎用药不能自行随意使用，尤其是抗生素类药物，必须在医生明确是细菌感染且有用药指征时才使用。同时，用药过程中要密切观察病情变化，如果用药后症状无改善甚至加重，应及时就医复诊，调整治疗方案。