扁桃体发炎时常用的药物有抗生素类和对症治疗药物等。一般细菌感染引起的扁桃体发炎，可选用青霉素类抗生素，如不过敏，青霉素V钾片是常用药物之一，一般用药后数天内症状会有所改善。
抗生素类药物
细菌性扁桃体炎常用药：如果是细菌感染导致的扁桃体发炎，常用青霉素类抗生素，像青霉素V钾片，它能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥杀菌作用。还有头孢菌素类抗生素，比如头孢克洛胶囊，对多种细菌有抗菌活性，可用于敏感菌引起的扁桃体炎症。注意事项：使用抗生素类药物前，一定要确认没有过敏史。比如对青霉素过敏的患者，就不能用青霉素V钾片，需换用其他合适的抗生素。
对症治疗药物
解热镇痛药：当扁桃体发炎伴有发热、咽痛较明显时，可使用解热镇痛药，像对乙酰氨基酚片，能通过抑制前列腺素合成，起到解热镇痛的作用，一般服用后0.5 - 1小时左右开始起效，缓解发热和咽痛症状。还有布洛芬缓释胶囊，同样具有解热镇痛功效，药效持续时间相对较长。局部用药：可以使用含漱液，如复方硼砂含漱液，能清洁口腔、杀菌消炎，减轻扁桃体局部的炎症反应。不过含漱时要注意正确方法，充分含漱使药物作用于扁桃体部位。
病毒感染相关药物
病毒性扁桃体炎情况：如果是病毒感染引起的扁桃体发炎，一般不需要使用抗生素。可使用一些清热解毒的中成药，比如蓝芩口服液，它能清热解毒、利咽消肿，缓解病毒性扁桃体炎引起的咽痛等症状。还有蒲地蓝消炎口服液，也有清热解毒、抗炎消肿的作用，对病毒感染导致的扁桃体发炎有一定疗效。
特殊人群用药
儿童患者：儿童扁桃体发炎用药需谨慎，比如儿童使用对乙酰氨基酚时，要根据体重计算合适的剂量。一般1 - 12岁儿童按体重一次10 - 15mg/kg，每4 - 6小时一次。而且儿童用抗生素类药物时，像头孢克洛颗粒，要严格按照儿童的年龄和体重来确定用量。孕妇患者：孕妇扁桃体发炎用药更要慎重，解热镇痛药中，对乙酰氨基酚相对较安全，但也需在医生指导下使用。抗生素类药物的选择要权衡利弊，必须由医生根据病情来决定是否用药及用何种药物。