小便时疼可能由以下几种疾病引起：
1.尿道炎：尿道炎是泌尿系统最常见的疾病之一，由细菌、真菌、病毒等感染引起。主要表现为尿频、尿急、尿痛，有时还会出现血尿。尿道炎可分为急性和慢性两种，急性尿道炎发病较急，症状明显，慢性尿道炎则症状较轻，容易被忽视。治疗尿道炎通常采用抗生素治疗，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱的炎症，主要由细菌感染引起。其症状与尿道炎相似，也会出现尿频、尿急、尿痛等症状，但膀胱炎的疼痛部位通常在耻骨上方，而非尿道口。治疗膀胱炎主要采用抗生素治疗，同时还需要注意休息、多饮水，以促进炎症的消退。
3.前列腺炎：前列腺炎是男性生殖系统的一种炎症，常见于中青年男性。其症状主要表现为尿频、尿急、尿痛、排尿困难、会阴部疼痛等。前列腺炎可分为急性和慢性两种，急性前列腺炎症状较重，需要及时治疗，慢性前列腺炎则症状较轻，但容易反复发作。治疗前列腺炎主要采用抗生素治疗，同时还需要注意生活习惯的调整，如避免久坐、少食辛辣食物、戒烟戒酒等。
4.泌尿系统结石：泌尿系统结石是泌尿系统中常见的疾病，包括肾结石、输尿管结石、膀胱结石等。结石可刺激尿路黏膜，引起疼痛、血尿等症状。疼痛通常较为剧烈，尤其是结石移动时。治疗泌尿系统结石的方法包括药物治疗、体外冲击波碎石、手术治疗等，具体治疗方法需要根据结石的大小、位置、数量等因素来选择。
5.其他疾病：除了上述疾病外，还有一些其他疾病也可能导致小便时疼痛，如泌尿系统肿瘤、间质性膀胱炎、尿道口炎等。这些疾病的症状和治疗方法各不相同，需要进一步检查和诊断。
总之，小便时疼痛可能是多种疾病的表现，如果出现这种症状，应及时就医，进行相关检查和治疗。同时，在日常生活中，应注意个人卫生，多饮水，避免憋尿，有助于预防泌尿系统疾病的发生。