怀孕初期孕酮低并伴有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：怀孕后，孕酮水平低可能导致先兆流产，出现少量阴道流血，常为暗红色或血性白带。此时需要注意休息，减少活动，禁止性生活，并在医生的指导下使用黄体酮等保胎药物。
2.宫外孕：宫外孕时，孕酮水平也会较低，伴有阴道流血。宫外孕是一种危险的情况，需要及时就医，通过超声等检查明确诊断，并采取相应的治疗措施，如手术或药物治疗。
3.其他：胚胎发育异常、宫颈息肉、阴道炎等也可能导致类似症状。
如果怀孕后出现孕酮低并有褐色分泌物，应及时就医，进行相关检查，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意以下几点：
1.卧床休息：减少活动，避免劳累和剧烈运动。
2.保持心情放松：紧张、焦虑等情绪可能对怀孕产生不利影响，保持心情愉悦有助于胎儿的健康。
3.合理饮食：增加富含蛋白质、维生素和矿物质的食物摄入，避免刺激性食物。
4.按照医生的建议进行复查：了解孕酮水平和胎儿的发育情况，及时调整治疗方案。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，治疗方法应根据具体情况而定。在怀孕期间，应遵循医生的建议，按时进行产前检查，确保自身和胎儿的健康。如果对孕酮低和褐色分泌物的情况有任何疑问或担忧，应及时与医生沟通。