血吸虫病的症状因感染阶段不同而有所差异。急性血吸虫病患者在感染后数小时至2个月内可能出现发热，体温多在38~40℃，可伴有畏寒、寒战等表现，还可能出现皮疹、咳嗽、胸痛等症状。
急性期症状：
发热表现： 多数患者会出现发热，体温曲线呈弛张热型，一般持续1~2个月。体温波动较大，一天内体温可波动1~2℃。过敏反应： 部分患者会出现皮疹，一般在发热期间出现，数量不等，以荨麻疹样皮疹较为常见，还可能有血管神经性水肿等表现。同时，可能伴有咳嗽、胸痛等呼吸道症状，这是因为血吸虫童虫在肺部移行时引起的过敏反应。
慢性期症状：
肠道症状： 患者可能出现腹痛、腹泻，一般为黏液血便，每天数次至十余次不等。病情迁延不愈的患者可能出现肝脾肿大，早期以肝肿大为主，尤其是左叶肝肿大较为常见，随着病情进展，脾脏逐渐肿大。其他表现： 部分患者会出现乏力、消瘦、劳动力下降等全身症状。有些患者还可能出现慢性支气管炎、肺源性心脏病等并发症相关的表现。
晚期症状：
肝硬化表现： 患者会出现门静脉高压，表现为脾肿大进行性加重、腹水，腹壁、食管胃底等部位的静脉曲张。还可能出现肝功能减退的表现，如消瘦、乏力、食欲减退、贫血等，患者面色灰暗黝黑，有蜘蛛痣、肝掌等。其他晚期表现： 女性患者可能出现月经不调等症状，儿童患者可能出现生长发育障碍，表现为身材矮小、智力减退等。