运动神经元病患者的存活时间差异较大，一般来说，多数患者在确诊后的3~5年内可能会因呼吸肌受累等原因导致呼吸衰竭等严重并发症而危及生命，但也有部分患者存活时间能超过5年甚至更久。
病情分型影响存活时间
肢体起病型：这类患者相对来说进展可能相对慢一些，存活时间有个体差异，有的可能能存活5年以上。比如一些以手部小肌肉无力、萎缩起病的患者，如果病情进展缓慢，对呼吸等重要功能影响较小，存活时间可能偏长。延髓起病型：往往病情进展相对较快，因为延髓受累会影响吞咽、呼吸等功能，一般存活时间可能在3~5年左右，但也有个别患者经过积极的支持治疗等，存活时间会有所延长。
治疗干预的作用
药物治疗方面：目前虽没有能完全治愈运动神经元病的特效药物，但一些药物可以起到一定延缓病情进展的作用。比如利鲁唑，它可以通过抑制谷氨酸释放等机制来延缓病程，但一般来说，使用利鲁唑等药物也只是在一定程度上延缓，不能改变最终的病程走向太多，不过能让患者的存活时间有一定延长，比如可能让存活时间比不使用药物的情况多几个月到一年左右。非药物支持治疗：良好的营养支持很重要，比如对于吞咽困难的患者，可能需要鼻饲营养，保证营养摄入，这样能维持身体机能，有助于延长存活时间；呼吸支持也很关键，当患者出现呼吸肌无力时，使用无创呼吸机等辅助呼吸，能帮助患者维持呼吸功能，从而延长存活时间。
患者自身情况的影响
年龄因素：年轻患者相对来说身体机能较好，对疾病的耐受能力可能相对强一些，存活时间可能相对长些；而老年患者身体各脏器功能相对较弱，可能更容易出现并发症，存活时间可能相对短些。比如一位30岁的运动神经元病患者和一位70岁的患者，往往30岁的患者存活时间可能更长一些。一般健康状况：本身有其他基础疾病的患者，比如同时有心血管疾病等，会增加治疗的复杂性和风险，可能会影响存活时间；而本身身体状况较好，没有其他严重基础疾病的患者，存活时间可能相对长些。