运动神经元病患者的存活时间差异较大，一般来说，多数患者在确诊后的3~5年内会因呼吸肌受累等原因导致呼吸衰竭等严重并发症而危及生命，但也有部分患者存活时间可超过10年。
病情分型影响存活时间
肌萎缩侧索硬化型：这是最常见的类型，病情进展相对较快，多数患者在发病后3~5年内会出现呼吸肌无力，需要依赖呼吸机维持生命，进而影响存活时间。进行性脊肌萎缩型：病情进展速度相对较慢，部分患者存活时间可以达到5年以上，甚至更长，但也有个体差异，有的患者病情也会逐渐加重影响呼吸等功能。进行性延髓麻痹型：患者多在发病后1~3年内出现吞咽困难、呼吸功能受损等情况，存活时间相对较短，多数在5年内。
治疗手段对存活时间的作用
药物治疗：目前有一些药物可以在一定程度上延缓病情进展，如利鲁唑，它可以延长患者的存活时间，一般能使患者的存活期延长3~6个月左右，但不能治愈疾病。呼吸支持治疗：对于出现呼吸肌无力的患者，及时进行无创通气或有创通气等呼吸支持治疗，可以改善患者的呼吸功能，从而延长存活时间。比如早期进行无创呼吸机辅助通气，能帮助患者维持较好的呼吸状态，让患者存活时间延长。营养支持：保证患者充足的营养摄入也很重要，对于吞咽困难的患者可以通过鼻饲等方式保证营养，良好的营养状态有助于患者维持身体机能，间接影响存活时间。
患者自身因素的影响
年龄因素：年轻患者相对来说身体机能较好，对疾病的耐受能力可能相对强一些，存活时间可能相对长些；而老年患者身体各器官功能衰退，可能会更快出现并发症，影响存活时间。基础健康状况：本身有其他基础疾病的患者，如合并心脏病等，在患运动神经元病后，病情相互影响，可能会使存活时间缩短；而基础健康状况良好的患者，存活时间可能相对长些。心理状态：积极乐观的心理状态有助于患者更好地配合治疗，也可能对病情的发展有一定的影响，进而影响存活时间，保持良好心态的患者可能相对更有利于延长存活时间。