慢性肠胃炎的药物治疗需根据具体症状来选，一般来说，抑制胃酸分泌的药物如质子泵抑制剂，常用的有奥美拉唑等，能减少胃酸对胃黏膜的刺激，通常可缓解因胃酸过多导致的胃部不适，这类药物价格因品牌等因素有所不同，国产的奥美拉唑大概几元到十几元一盒。
针对不同症状的用药
缓解腹痛类：如果是腹痛明显，可使用抗胆碱能药物，如山莨菪碱，它能解除胃肠道平滑肌痉挛，缓解疼痛，但青光眼患者禁用。改善腹泻类：对于腹泻症状，可使用蒙脱石散，它能在肠道内形成一层保护膜，吸附病原体和毒素，起到止泻作用，一般成人一次1袋（3克），一日3次。
保护胃黏膜的药物
铝碳酸镁：能中和胃酸，同时保护胃黏膜，它可以持续中和胃酸1 - 2小时，缓解胃部灼热、疼痛等不适，常见规格的铝碳酸镁片大概十几元一盒。硫糖铝：它在溃疡面或炎症处形成保护膜，促进黏膜再生和溃疡愈合，不过肾功能不全者长期服用可能会引起铝蓄积中毒，需谨慎使用。
调节肠道菌群的药物
双歧杆菌四联活菌片：含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等多种有益菌，能调节肠道菌群平衡，改善肠道功能，一般一次2 - 3片，一日3次，冷藏保存。地衣芽孢杆菌活菌胶囊：可促进肠道有益菌生长，抑制有害菌繁殖，从而调整肠道菌群，成人一次1粒，一日3次。
注意事项
特殊人群：老年人使用药物时要更谨慎，比如铝碳酸镁长期大量服用可能影响磷的吸收，老年人本身可能存在磷代谢相关问题，需在医生指导下使用。儿童使用调节肠道菌群药物时，要选择适合儿童的剂型，且剂量需严格按照儿童体重等情况调整，避免自行用药。同时，在服用多种药物时，要注意药物之间的相互作用，最好在医生或药师的指导下合理用药。