咳嗽喉咙很痛通常是由多种原因引起的，比如上呼吸道感染，其中病毒性上呼吸道感染较为常见，约占上呼吸道感染的70%~80%，主要由鼻病毒、冠状病毒等引起。
上呼吸道感染导致
病毒性感染： 像鼻病毒引发的上呼吸道感染，除了咳嗽喉咙痛，还可能伴有鼻塞、流涕等症状，一般病程在7天左右能自行缓解，但如果症状明显，可使用一些缓解症状的药物，如含有右美沙芬的止咳药来减轻咳嗽。细菌性感染： 比如A组乙型溶血性链球菌感染，除了咳嗽喉咙痛，还可能出现高热，体温可达39℃左右，咽部会有明显的充血、肿胀，有的还会有脓性分泌物。
急性扁桃体炎引起
病原体感染： 主要致病菌是乙型溶血性链球菌，其次为葡萄球菌、肺炎链球菌等。急性扁桃体炎发作时，喉咙痛会比较剧烈，尤其是吞咽时，同时可能伴有咳嗽，检查可见扁桃体充血、肿大，表面有脓性分泌物。儿童患急性扁桃体炎时，要注意观察体温变化，若体温超过38.5℃，可使用布洛芬等退烧药来降温。
咽炎导致
急性咽炎： 多由病毒感染引起，如柯萨奇病毒、腺病毒等，也可由细菌感染导致，常见的细菌有A组乙型溶血性链球菌。患者会有喉咙痛、咳嗽症状，喉咙黏膜充血、红肿，病情较轻的可能在1周内恢复，严重的可能需要使用抗生素治疗，如青霉素类抗生素，但使用前需确认患者是否对青霉素过敏。慢性咽炎： 常由急性咽炎反复发作、长期吸烟、饮酒、空气污染等因素引起，喉咙痛一般是间歇性的，咳嗽多为刺激性干咳，病程较长，可达数月甚至数年，患者要注意避免吸烟、饮酒等不良习惯，保持室内空气湿润。