咳嗽喉咙痛通常由多种原因引起，比如上呼吸道感染，其中病毒性上呼吸道感染较为常见，约占急性上呼吸道感染的70% - 80%，主要由鼻病毒、冠状病毒等引起。
常见原因一：上呼吸道感染
病毒性上呼吸道感染： 除了鼻病毒、冠状病毒，还有流感病毒等也可导致。流感病毒引起的上呼吸道感染，往往起病急，除了咳嗽喉咙痛，还可能有高热（体温可达39℃ - 40℃）、头痛、全身酸痛等症状。细菌性上呼吸道感染： 常见的致病菌有A组β溶血性链球菌等。由细菌感染引起的咳嗽喉咙痛，可能喉咙局部红肿更明显，有的还会有脓性分泌物。
常见原因二：急性咽炎
病毒感染引发： 很多病毒都能导致急性咽炎，像柯萨奇病毒、腺病毒等。这类原因引起的咳嗽喉咙痛，可能会有咽部干燥、灼热感，随后出现疼痛，吞咽时加重。细菌感染引发： 同样是A组β溶血性链球菌等细菌作祟。患者除了咳嗽喉咙痛，检查时能看到咽部明显充血，扁桃体可能肿大，有脓性分泌物附着。
常见原因三：过敏因素
吸入性过敏原： 比如花粉、尘螨等。接触后很快就可能出现咳嗽喉咙痛，还常伴有打喷嚏、流鼻涕等症状，脱离过敏原环境后，症状可能会有所缓解。食物性过敏原： 某些人对特定食物过敏，像海鲜、芒果等。食用后可能出现喉咙痒、咳嗽、疼痛，同时可能伴有皮肤瘙痒、皮疹等表现。