肝癌的检查方式有多种，通常可以通过血液检查、影像学检查等方法来发现。比如甲胎蛋白（AFP）检测就是常用的血液检查手段之一，一般AFP大于400μg/L持续1个月，或大于200μg/L持续2个月，结合影像学检查等可辅助诊断肝癌。
血液检查方面
甲胎蛋白检测： 甲胎蛋白是一种糖蛋白，正常情况下，这种蛋白主要来自胚胎的肝细胞，出生后约2~3个月甲胎蛋白从血液中消失，正常人血清中甲胎蛋白的含量尚不到20μg/L。但当肝细胞发生癌变时，又能重新恢复产生这种蛋白质的功能，所以检测甲胎蛋白对肝癌的筛查有一定意义。一般如果甲胎蛋白数值异常升高，就要进一步检查。肝功能检查： 肝癌患者的肝功能会有一定程度的异常，比如谷丙转氨酶、谷草转氨酶等可能会升高，胆红素也可能出现异常，但肝功能检查只是辅助诊断，不能单纯依靠它确诊肝癌。
影像学检查方面
超声检查： 超声检查是肝癌筛查的常用方法之一，它操作简便、价格相对较低，而且可以实时观察肝脏的形态、结构等。超声检查能够发现肝脏内直径1~2厘米左右的占位性病变，不过对于一些较小的、位置较隐匿的病灶可能会有漏诊的情况。CT检查： CT检查可以更清晰地显示肝脏的病变情况，能够发现更小的病灶，还可以观察病灶与周围血管的关系等。增强CT扫描可以更准确地判断病变的血供情况，有助于鉴别肝癌和肝血管瘤等其他肝脏占位性病变。一般进行CT检查时需要注射造影剂，检查前要注意空腹等要求。磁共振成像（MRI）： MRI对肝癌的诊断价值也比较高，尤其是在鉴别诊断方面有独特的优势。它可以从多个方位成像，对软组织的分辨力比CT更高，对于一些微小病灶的检出和肝癌的定性诊断有重要作用。不过MRI检查时间相对较长，体内有金属植入物的患者可能不适合做MRI检查。
肝穿刺活检
原理： 肝穿刺活检是在超声或CT引导下，通过穿刺针获取肝脏组织进行病理检查，这是确诊肝癌的金标准。如果通过其他检查高度怀疑肝癌，但又不能明确诊断时，可以考虑进行肝穿刺活检。不过肝穿刺活检是有创检查，可能会有出血、感染等风险，需要严格掌握适应证和禁忌证。比如有严重凝血功能障碍的患者一般不适合做肝穿刺活检。