做胃镜肠镜是否会痛苦取决于具体的检查方式。普通胃肠镜检查较为痛苦，而无痛胃肠镜检查通常不会带来痛苦。
胃肠镜检查主要包括普通胃肠镜和无痛胃肠镜这两种方式：
一、普通胃肠镜检查：患者在进行该项检查时，只是对口咽部或肛门使用局部麻醉药物，然后在意识清醒的状态下进行胃肠镜检查。由于胃肠镜在进镜过程中会产生明显的刺激，会引发呕吐或肛门的不适感，所以整个检查过程比较痛苦。
1.在进镜时，会对相关部位造成较强刺激。
2.患者会感受到明显的呕吐感或肛门不适。
二、无痛胃肠镜检查：这种情况下是在检查前通过静脉输注全身麻醉药物，使患者处于短暂的意识丧失状态后再进行胃肠镜检查。因为在检查过程中患者没有意识，所以一般不会感觉到痛苦。
1.通过静脉给予全麻药物。
2.患者意识丧失，不会感知到痛苦。
总之，在选择胃肠镜检查方式时，需要根据自身情况综合考虑，以确定哪种方式更适合自己。同时，不管选择哪种方式，都应该在正规医疗机构由专业人员进行操作。