新型冠状病毒感染（新型肺炎）部分患者可能会有后遗症，比如约有10%-30%的患者在病愈后3个月仍存在多种症状，持续时间超过12周，称为长新冠。
呼吸系统方面的后遗症
呼吸相关不适： 部分患者会有呼吸困难的情况，活动后加重。还有些人会持续咳嗽，尤其是在受到刺激时咳嗽更明显，这种咳嗽可能会持续数周甚至数月。肺功能异常： 一些患者进行肺功能检查会发现存在不同程度的肺功能下降，比如肺活量降低等情况，不过大部分患者的肺功能会在数月内逐渐恢复，但也有少数人会遗留长期的肺功能受损。
神经系统方面的后遗症
头痛头晕： 有相当比例的患者病愈后会经常出现头痛症状，疼痛程度轻重不一，同时还可能伴有头晕，影响日常的工作和生活。睡眠障碍： 部分患者会出现睡眠问题，比如入睡困难、睡眠浅易惊醒等，导致精神状态不佳，影响生活质量。另外，还可能出现记忆力减退、注意力不集中等情况，在工作学习时难以集中精力。
心血管系统方面的后遗症
心悸胸闷： 患者可能会感觉心慌、心跳异常，或者有胸部发闷的感觉，活动时这种不适可能会更明显。血压心率异常： 少数患者会出现血压波动，比如血压不稳定，或者心率异常，如心率过快或过慢等情况，但多数会在一段时间后逐渐恢复正常，但也有个别情况会持续存在。
其他方面的后遗症
疲劳乏力： 很多患者会长期存在疲劳感，即使经过适当休息也难以缓解，严重影响日常的体力活动，比如稍微活动就会感觉极度疲惫。心理健康问题： 部分患者会出现焦虑、抑郁等心理健康问题，因为长期受身体不适的困扰，情绪容易低落，对生活的信心受到一定影响。