孩子肚子疼发烧可能由多种原因引起，比如常见的急性上呼吸道感染累及胃肠道时，约有10%的孩子会出现腹痛、恶心、呕吐等消化道症状，一般病程在1周左右。
一、感染性因素
1. 肠道病毒感染：
病毒性肠炎：像轮状病毒感染较为常见，多发生在秋冬季节，孩子除了发烧、肚子疼，还会频繁腹泻，大便呈蛋花汤样，每天可能腹泻十几次甚至更多。细菌性痢疾：由痢疾杆菌引起，孩子会有发热、腹痛、腹泻，大便多为黏液脓血便，每天排便次数较多，可能达十余次。
2. 腹腔内器官感染：
急性阑尾炎：典型表现是开始为脐周疼痛，数小时后转移至右下腹，同时伴有发热，体温可达到38℃~39℃，甚至更高。胆囊炎：多因胆道梗阻合并感染引起，孩子右上腹会有疼痛，伴有发热，疼痛可能会放射到右肩背部。
二、非感染性因素
1. 腹部脏器扭转或梗阻：
肠套叠：多见于2岁以内婴幼儿，主要表现为突发的剧烈腹痛、哭闹不安，伴有呕吐，随后可能排出果酱样大便，同时伴有发热，一般体温在38℃左右。肠梗阻：孩子会出现腹痛、呕吐、腹胀、停止排气排便，同时伴有发热，体温高低取决于梗阻的严重程度和是否有感染。
2. 过敏性因素：
腹型过敏性紫癜：除了皮肤出现紫癜外，还会有腹痛、恶心、呕吐，部分孩子伴有发热，腹痛多为阵发性绞痛，部位不固定。