淋菌性咽喉炎主要通过抗生素治疗，一般使用头孢曲松等药物，通常7天左右能有明显改善。
抗生素选择
头孢曲松： 是治疗淋菌性咽喉炎的常用药物之一，属于第三代头孢菌素，对淋病奈瑟菌有较好的抗菌作用。它能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥杀菌作用。大观霉素： 对于一些对头孢类药物耐药的情况，大观霉素也可选用。它通过与细菌核糖体30S亚单位结合，抑制细菌蛋白质的合成。
治疗中的注意事项
性伴侣同时治疗： 在治疗淋菌性咽喉炎期间，患者的性伴侣也需要同时进行检查和治疗，以免发生再次感染。一般建议在患者开始治疗后的7天内，性伴侣也接受相应的检查和处理。避免高危行为： 治疗期间要避免无保护的性行为，防止疾病传播给他人。同时，要注意个人卫生，保持口腔清洁，有助于病情的恢复。
特殊人群情况
孕妇患者： 孕妇患淋菌性咽喉炎时，用药需要特别谨慎。应选择对胎儿影响较小的抗生素，如头孢曲松，但是用药必须在医生的严格指导下进行，医生会权衡治疗效益和可能的风险。儿童患者： 儿童患淋菌性咽喉炎相对较少见，但如果发生，选择抗生素时要考虑儿童的年龄、体重等因素。一般会选择合适的头孢类抗生素，但剂量等需要严格按照儿童的标准来调整，必须由儿科医生根据具体情况制定治疗方案。