淋菌性咽炎主要通过抗生素治疗，一般使用头孢曲松等药物，通常7天左右能取得较好效果。
常用治疗药物
头孢曲松： 是治疗淋菌性咽炎的常用药物之一，属于第三代头孢菌素，对淋球菌有较好的抗菌活性。它通过抑制细菌细胞壁的合成发挥杀菌作用。大观霉素： 对于一些对头孢菌素耐药的淋球菌感染也可选用大观霉素，肌肉注射给药，能有效杀灭淋球菌。
治疗中的注意事项
性伴侣同时治疗： 淋菌性咽炎患者的性伴侣也需要同时进行检查和治疗，因为在性行为中很可能会相互传染，避免治愈后再次感染。一般建议在患者治疗期间，性伴侣要一起接受相关检查，排除感染后再恢复无保护性行为。治疗期间避免性行为： 在治疗淋菌性咽炎期间，一定要避免性行为，防止疾病传播给他人，同时也有助于患者自身病情的恢复。一般需要等到规范治疗结束，经医生评估治愈后才能恢复正常的性生活。
特殊人群的情况
孕妇患者： 孕妇患淋菌性咽炎时用药需谨慎，应选择对胎儿影响较小的抗生素。例如，头孢曲松相对较安全，但也需要在医生的严格指导下使用，医生会权衡治疗效益和可能的风险来选择合适的药物及剂量。儿童患者： 儿童患淋菌性咽炎比较少见，但如果发生，用药要更加谨慎。一般会根据儿童的体重等情况来选择合适的抗生素，剂量也需要精确计算，通常会避免使用可能对儿童生长发育有较大影响的药物类型，多选用相对安全且有效的抗生素进行治疗。