脑萎缩目前尚无特效的根治药物，但可以根据具体症状使用一些药物来缓解。比如对于伴有认知功能障碍的患者，可能会用到胆碱酯酶抑制剂，像多奈哌齐等，它能在一定程度上改善认知症状，但一般很难达到彻底治愈且让脑萎缩完全逆转的效果。
改善认知症状的药物
胆碱酯酶抑制剂：多奈哌齐是常见的胆碱酯酶抑制剂，它可以通过抑制胆碱酯酶活性，增加脑内乙酰胆碱含量，从而改善轻至中度阿尔茨海默病患者的认知功能，但它不能阻止脑萎缩的进展。NMDA受体拮抗剂：美金刚也是常用药物，主要用于中重度阿尔茨海默病患者，能调节谷氨酸活性，对保护神经细胞有一定作用，可在一定程度上缓解认知功能的进一步恶化。
针对伴随症状的药物
精神症状药物：如果脑萎缩患者出现精神行为症状，如幻觉、妄想、抑郁等，可能会用到抗精神病药物或抗抑郁药物。抗精神病药物如奥氮平，可用于控制幻觉、妄想等症状，但要注意其可能带来的嗜睡、体重增加等副作用；抗抑郁药物如舍曲林，能改善抑郁情绪，但使用时需监测患者的情绪变化和药物不良反应。癫痫药物：若脑萎缩患者合并癫痫发作，会根据癫痫类型选用抗癫痫药物，如丙戊酸钠，它可用于多种类型癫痫的治疗，但用药过程中要定期监测肝功能等指标。
营养神经类药物
神经营养剂：像胞磷胆碱钠，它可以促进大脑代谢，改善脑功能，对脑萎缩有一定的辅助治疗作用。不过它只是起到营养神经、促进脑代谢的辅助效果，不能从根本上逆转脑萎缩。脑蛋白水解物：脑蛋白水解物能提供脑代谢所需的氨基酸和磷脂类物质，有利于神经细胞的蛋白质合成及加强脑神经的呼吸作用，对脑功能有一定的改善作用，但同样不能阻止脑萎缩的发展进程。
特殊人群用药注意
老年人：老年人使用上述药物时要特别注意药物相互作用，比如多奈哌齐与某些抗心律失常药物合用时需谨慎。同时，要密切观察药物不良反应，因为老年人肝肾功能可能有所减退，药物代谢能力下降。肝肾功能不全者：对于肝肾功能不全的脑萎缩患者，使用一些药物时要调整剂量或选择合适的药物，像美金刚在肾功能不全时需要根据肌酐清除率来调整剂量，避免药物在体内蓄积导致不良反应加重。