盆腔囊肿的形成原因较多，其中炎症刺激是常见因素之一。比如盆腔炎反复发作，长时间的炎症刺激可能导致局部组织渗出、包裹，进而形成囊肿，这种情况在一些妇科炎症患者中较为常见。
炎症相关因素
盆腔炎性囊肿：女性盆腔内的器官如子宫、输卵管、卵巢等发生炎症，像输卵管炎、卵巢炎等，炎症会使局部组织充血、水肿，炎性渗出物积聚，慢慢就可能形成囊肿。一般这类患者可能会有下腹部疼痛、阴道分泌物增多等表现。阑尾炎症波及：阑尾与盆腔邻近，若阑尾发生炎症，如急性阑尾炎没有及时治疗，炎症可能蔓延至盆腔，影响盆腔组织，也有可能引发盆腔囊肿。
子宫内膜异位相关
卵巢子宫内膜异位囊肿：子宫内膜组织出现在盆腔内异位生长，当异位的子宫内膜在卵巢上种植，随着月经周期出血，血液积聚在卵巢内形成囊肿，通常称为巧克力囊肿。这类患者往往会有痛经进行性加重、不孕等情况，痛经可能从月经前1 - 2天开始，持续整个经期。盆腔其他部位子宫内膜异位囊肿：子宫内膜异位组织还可能出现在盆腔其他部位，如盆腔腹膜等，也会形成囊肿，但相对卵巢子宫内膜异位囊肿发生率低一些。
先天发育异常
苗勒管发育异常相关囊肿：在胚胎发育过程中，苗勒管发育出现异常，可能形成一些先天性的盆腔囊肿。比如中肾管囊肿，是胚胎时期中肾管遗迹残留形成的囊肿，一般较小，多无明显症状，常在体检时发现。副中肾管囊肿：由副中肾管发育异常导致，也属于先天性盆腔囊肿的一种类型，通常囊肿较小，若不影响周围组织，可能长期无明显表现。