尿道肉阜的治疗方法需根据病情来定，一般较小且无症状的尿道肉阜可先观察，而有症状或较大的可能需要手术等干预。
非手术治疗方式
局部雌激素治疗：对于因雌激素水平降低引起的尿道肉阜，可局部使用雌激素软膏。比如绝经后女性出现尿道肉阜，使用雌激素软膏有一定改善作用，但使用时要注意可能存在的局部刺激等情况，且需在医生指导下根据个体雌激素水平等情况来应用。抗生素治疗：如果尿道肉阜伴有感染，出现红肿、疼痛等炎症表现时，可使用抗生素。一般会根据感染的病原体选择合适的抗生素，如细菌感染常用的广谱抗生素等，但要避免自行滥用抗生素，需遵医嘱使用。
手术治疗情况
手术切除：当尿道肉阜较大、症状明显影响生活，如出现排尿困难、出血等情况时，多考虑手术切除。手术方式有多种，如简单的肉阜切除术等。手术一般在局部麻醉下进行，术后需要注意伤口护理，保持局部清洁，避免感染等。术后要定期复查，观察伤口愈合情况以及有无复发等。
术后康复与注意事项
术后休息与护理：术后患者需要适当休息，避免剧烈运动。要保持会阴部清洁，按照医生要求进行伤口换药等护理操作。一般术后1 - 2周伤口可逐渐愈合。在康复期间要注意观察尿道肉阜有无复发迹象，如再次出现尿道局部的异常增生物等情况。生活方式调整：患者在治疗后要注意保持良好的生活习惯，多喝水，每天保证足够的饮水量，一般建议不少于1500 - 2000毫升，以增加尿液排出，起到冲洗尿道的作用，减少尿道感染等情况的发生风险。同时要注意个人卫生，保持外阴清洁，勤换内裤等。