复方玄驹胶囊可能出现的副作用主要有以下几方面情况：
消化系统方面
胃肠道不适：部分人服用后可能出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状。有临床观察发现，约10%左右的服药者会出现不同程度的胃肠道反应，表现为服药后胃部有不适感，严重些的会出现腹痛、腹泻，影响正常的消化功能。食欲变化：少数人可能会出现食欲减退的情况，原本正常的饮食习惯受到影响，进食量较服药前减少。
神经系统方面
头晕乏力：大概有5% - 8%的人服用后会感觉头晕、身体乏力，精神状态不如服药前，影响日常的工作和生活状态。比如原本精力充沛的人，服药后会觉得容易疲倦，做事提不起劲，注意力也难以集中。嗜睡：个别人可能会出现嗜睡的表现，整天昏昏欲睡，影响正常的作息和活动。
皮肤方面
皮肤瘙痒：极少数人服药后可能出现皮肤瘙痒的症状，皮肤会有不同程度的瘙痒感，搔抓后可能会出现皮肤发红等表现，但一般停药后症状会逐渐缓解。不过这种情况虽然发生率低，但也需要引起注意。皮疹：极个别情况下会出现皮疹，皮肤表面出现一些红色的小丘疹，可能伴有瘙痒等不适，若出现这种情况应及时就医处理。
其他方面
上火表现：因为复方玄驹胶囊有一定温肾壮阳的作用，部分人服用后可能出现上火的症状，比如口干、咽干、口舌生疮等，表现为口腔内出现溃疡，喝水时会有疼痛感等。不过这种情况相对来说发生概率不是很高，但也是需要关注的可能副作用之一。