药流不干净清宫可能导致的危害包括：感染、子宫颈或内膜粘连、子宫穿孔。
一、感染：清宫手术属于有创操作。1.如果手术前、中、后的无菌操作不够严格，比如手术器械消毒不彻底、手术环境不达标等；2.或是术后患者不注意个人卫生，比如过早盆浴、不勤换卫生巾等，都可能引发子宫内感染，并且感染还有可能进一步侵犯输卵管及盆腔，从而对生殖系统健康造成严重威胁。
二、子宫颈或内膜粘连：进行清宫手术时，有可能会造成子宫颈或内膜受到损伤以及出现炎症反应。(1)这会显著增加术后子宫颈或内膜粘连的发生几率；(2)这种粘连会引发月经异常现象，例如出现无月经或月经量过少等情况。
三、子宫穿孔：药物流产后子宫内膜通常已经比较薄，此时再进行清宫处理属于二次损伤。(1)如果操作不当，就很有可能导致子宫穿孔；(2)会伴随出现严重腹痛、大出血等危险状况。
总之，药流不干净清宫会给身体带来多种严重危害，需要谨慎对待并做好相应预防和处理措施。