疱疹性咽颊炎主要由肠道病毒引起，治疗上首先要进行对症支持。一般来说，病程大概在1-2周左右能自愈，但期间可以通过一些措施缓解症状。
一般对症处理
休息与隔离： 患者需要多休息，避免劳累，同时因为具有传染性，要进行隔离，防止交叉感染，一般隔离时间建议2周左右。口腔护理： 保持口腔清洁，可用淡盐水漱口，年龄较小的儿童可以用生理盐水擦拭口腔，每天2-3次，减轻口腔不适。
药物缓解症状
退热药物： 如果体温超过38.5℃，可以使用对乙酰氨基酚来退热，适用于3个月以上的儿童和成人，每次用药间隔4-6小时，24小时内不超过4次。对于6个月以上的婴儿，也可以选用布洛芬退热，每6-8小时一次，24小时不超过4次。缓解咽痛药物： 可以使用含有利多卡因的喷雾来缓解咽痛，但要注意2岁以下儿童慎用，使用时按照说明书的剂量和方法操作。
抗病毒治疗
目前对于肠道病毒感染引起的疱疹性咽颊炎，没有特效的抗病毒药物。但如果是由柯萨奇A组病毒等引起，一般不推荐常规使用抗病毒药物。不过对于重症患者或者有特殊情况的，可以在医生评估下考虑使用干扰素等，但使用干扰素时要注意可能出现的不良反应，如发热、寒战等，儿童使用需谨慎。
饮食注意事项
营养摄入： 患病期间要保证充足的营养摄入，选择易消化、富含维生素的食物，如小米粥、蔬菜泥、水果汁等。避免吃辛辣、刺激性、过烫的食物，这些食物会加重咽部疼痛，影响病情恢复。一般建议每天保证摄入1-2斤的蔬菜水果，以补充维生素C等增强抵抗力。