治疗结石的方法有多种，比如药物治疗、体外冲击波碎石以及手术治疗等。对于一些较小的结石，药物治疗可能是一种选择，像治疗尿路结石的枸橼酸氢钾钠，它可以通过碱化尿液等作用，帮助部分较小的结石排出，但一般来说，结石直径小于6毫米的尿路结石有机会通过药物辅助排出，不过也不是所有结石都能靠药物排出。
药物治疗方面
促进结石排出的药物： 常见的有α受体阻滞剂，如坦索罗辛等，它可以松弛输尿管平滑肌，有助于结石排出。不过这类药物需要在医生指导下使用，它主要适用于输尿管中下段结石。还有一些溶石药物，比如对于尿酸结石可以使用别嘌醇等药物来帮助溶解结石，但溶石过程相对较慢，而且不是所有结石都适合溶石治疗。缓解疼痛的药物： 当结石引起疼痛时，会使用非甾体抗炎药，像双氯芬酸钠等，能起到消炎止痛的作用。如果疼痛较为剧烈，可能会用到阿片类镇痛药，如哌替啶等，但阿片类药物有一定的成瘾风险，需谨慎使用。
体外冲击波碎石
适用情况： 适用于直径一般在2 - 2厘米以下的肾结石以及直径在1 - 1厘米以下的输尿管结石。它是利用高能冲击波聚焦后作用于结石，使结石裂解，然后随尿液排出体外。治疗过程： 患者需要躺在特定的设备上，医生定位好结石位置后进行冲击波治疗。一般来说，一次体外冲击波碎石可能无法完全粉碎结石，有时需要多次治疗。治疗后要注意观察尿液中是否有结石碎片排出，同时要多喝水，促进结石排出。
手术治疗
微创手术： 比如经皮肾镜取石术，适用于较大的肾结石，尤其是那些直径大于2厘米的结石。手术是通过经皮肤穿刺建立通道进入肾脏，然后用器械取出结石。这种手术创伤相对较小，恢复较快。还有输尿管镜取石术，适用于输尿管中下段的结石，通过尿道插入输尿管镜，找到结石后用激光等将结石击碎并取出。开放性手术： 现在已经较少采用，主要用于一些非常复杂、其他微创方法无法处理的结石情况。开放性手术创伤大，恢复时间长，所以一般是在其他方法不适用时才会考虑。