来月经肛门痛可能是以下原因导致：
一、月经不良反应
来月经时体内激素水平会发生变化，易引起盆腔充血。若充血较为严重，可能会对肛门产生刺激，从而导致肛门部位出现疼痛感觉。这属于正常生理现象，通常无需特殊治疗。可采取温水坐浴或温水清洗的方式，有助于改善局部疼痛症状。
二、痔疮
肛门病变如内痔或外痔，通常伴有局部充血。在月经期间受到刺激后，往往会使疼痛症状加重。需要局部使用一些消炎或活血止痛类的药膏涂抹，比如消痛贴膏、活血止痛膏等，能够加快局部代谢，促进炎症吸收，从而缓解局部疼痛。
三、肛周脓肿
这是一种较为常见的疾病，通常会有肛门红肿和疼痛的表现。来月经时可能出现肛门痛，尤其在大便过程中，疼痛会明显加重。一般需要配合医生使用头孢类消炎药物治疗，比如头孢克肟。
总之，当出现来月经肛门痛时，要注意观察，若疼痛持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时就医，明确原因后进行针对性治疗。