月经干净第一天同房是否会怀孕不能确定，需分情况分析。
一、不会怀孕。通常来讲，若女性平时月经周期约一个月且较规律，那么排卵期多在月经中期。月经刚干净第一天，从时间看尚未到排卵期，此时即便同房未采取避孕措施，等排卵时精子已失去活性，所以一般不会怀孕。
二、会怀孕。在部分情况下，有些女性月经周期较短，可能月经刚干净就出现意外排卵，若此时同房未采取有效避孕，就有可能怀孕。要注意，利用安全期避孕并不可靠，若不打算要孩子，需采取有效避孕措施。
总之，月经干净第一天同房能否怀孕存在不确定性，要根据具体情况判断，安全期避孕不可靠，应重视有效避孕。