男人射精后小肚子疼可能由慢性前列腺炎、精囊炎、精索静脉曲张所导致。
一、慢性前列腺炎：这是指由于病原微生物感染或者即便无感染但前列腺长时间处于慢性充血状态而引起的慢性炎症，属于常见的男性泌尿生殖系统疾病。其主要症状之一就是射精后小肚子疼。具体来说，慢性前列腺炎的发生可能与多种因素有关，比如病原体感染，包括细菌、支原体、衣原体等；排尿功能障碍，尿液反流刺激前列腺；精神心理因素等。患者除了射精后腹痛，还可能出现尿频、尿急、尿痛、尿不尽、尿等待等排尿异常表现，以及会阴部、下腹、腰骶部等部位的疼痛不适。
二、精囊炎：即精囊发生炎症。一部分患者会有射精疼痛、下腹部不适的情况，甚至可能伴有排尿异常等症状。精囊炎多由细菌等病原体经尿道逆行感染所致，也可因前列腺炎等邻近器官炎症蔓延而引发。其主要表现除了上述症状外，还可能有血精，即精液中带有血液。
三、精索静脉曲张：指精索蔓状血管丛因各种原因导致血液淤滞，进而出现局部静脉扩张、迂曲的现象。这也会造成射精后小肚子疼。精索静脉曲张的原因主要有精索内静脉瓣膜发育不全、左侧精索内静脉呈直角注入左肾静脉等解剖因素，以及长时间站立、重体力劳动等诱发因素。患者可能还会有阴囊坠胀感、隐痛等表现，久站或步行后症状可加重，平卧休息后可缓解。
男人射精后小肚子疼还可能存在其他原因，若出现这种情况，建议及时前往医院就诊，完善相关检查以明确病因，并给予针对性的处理或治疗。