植物神经紊乱形成的原因较为复杂，长期的精神紧张、心理压力过大是常见因素之一，比如长期处于高强度工作环境、面临重大生活事件打击等情况，有研究显示约30% - 50%的植物神经紊乱患者与长期精神过度紧张相关。
一、精神心理因素方面
长期精神紧张： 当人长期处于高度紧张的状态时，比如工作中长时间面临繁重任务且得不到有效舒缓，大脑皮层一直处于兴奋状态，会影响植物神经的正常调节功能。像一些高考学生，考前长期精神高度紧张，就容易出现植物神经紊乱相关症状。心理压力过大： 持续的心理压力，例如经济压力、人际关系压力等，会使得身体一直处于应激状态，进而干扰植物神经的平衡。比如一些人因家庭经济负担重，长期心理压力大，就可能引发植物神经紊乱。
二、遗传因素影响
家族遗传倾向： 研究发现，植物神经紊乱有一定的遗传易感性。如果家族中有亲属曾患植物神经紊乱，那么其后代患病的风险相对会有所增高。不过遗传因素并非绝对致病因素，只是增加了患病的可能性。基因相关影响： 某些特定基因的突变或异常表达可能与植物神经紊乱的发生有关，但具体的基因机制还在进一步研究中，目前已发现一些与神经调节相关的基因在植物神经紊乱患者中存在不同程度的异常情况。
三、环境因素作用
生活环境突变： 突然的生活环境改变，如从熟悉的城市搬到陌生环境、工作环境突发重大变化等，人体需要时间去适应新环境，若适应不良就可能引发植物神经紊乱。例如有人从农村搬到大城市生活，短时间内不适应城市快节奏生活，就容易出现植物神经紊乱症状。不良生活习惯： 长期的不良生活习惯也会影响植物神经。比如长期熬夜，打乱了人体正常的生物钟，影响植物神经的节律性调节；长期吸烟、酗酒，烟草中的尼古丁和酒精都会对神经系统产生不良影响，进而干扰植物神经功能。像长期熬夜的人，往往更容易出现睡眠障碍、情绪波动等植物神经紊乱相关表现。