小孩消化不良发烧可通过以下方式处理：
一、降温：
1.不论何种原因导致发烧，都会对小孩造成不同程度损伤，可能伴随发热性惊厥、呼吸心率增快、脱水等症状。若体温在38.5℃以上，可遵医嘱使用对乙酰氨基酚或布洛芬等药物进行降温。
2.体温在38.5℃以下，可采取物理降温，如多喝水、用温水擦拭身体等。
二、调节饮食：
1.小孩消化不良且发烧时，要注意调节饮食，尽量进食清淡、易消化的半流质食物，如小米粥、菜粥、面片汤等。这样的食物既不会增加胃肠负担，又能适当补充营养、水电解质，有助于小孩发热症状的缓解。
三、按摩：
1.消化不良时胃肠蠕动通常会出现异常，可适当对脐部进行按摩，对小孩消化不良有一定帮助。
2.也可对小孩的十指尖进行反复按摩，有清热去火的作用。
当症状不缓解时，应及时到医院进行相关检查，查明原因并进行针对性治疗。需明确小孩胃肠道发热是细菌感染还是病毒感染，针对不同感染源，抗炎治疗会有所不同。
总结概况提示：小孩消化不良发烧可从降温、饮食调节、按摩等方面着手处理，若症状持续不缓解要及时就医检查并明确感染源，以便进行针对性治疗。