三个月婴儿感冒咳嗽，可采取以下方法治疗：
1.保持适宜的环境：室内温度应保持在20-26℃，湿度保持在60%左右。定期通风，保持室内空气清新。
2.补充水分：感冒咳嗽会使婴儿流失大量水分，因此要及时补充水分，可适量喂水或母乳。
3.清理鼻腔：使用生理性海盐水滴鼻或喷鼻，软化、稀释鼻腔分泌物，然后使用吸鼻器吸出分泌物，以保持呼吸通畅。
4.对症治疗：如果咳嗽严重，影响婴儿睡眠和进食，可在医生指导下使用止咳祛痰药，如氨溴索、氨溴特罗等。
5.就医治疗：如果婴儿感冒咳嗽症状持续加重或出现发热、呼吸急促等异常情况，应及时就医，明确病因，在医生指导下进行治疗。
需要注意的是，以上方法仅供参考，具体治疗方法应根据婴儿的具体情况而定。如果对婴儿的病情有任何疑虑，建议及时咨询医生。同时，在治疗过程中，要密切观察婴儿的病情变化，如有异常应及时就医。