急性尿道感染主要是由细菌等病原体入侵尿道引起的。一般来说，女性更容易患急性尿道感染，这与女性尿道短、宽且直的解剖结构有关，大约有10% - 20%的女性在一生中会至少发生一次急性尿道感染。
病原体感染途径
上行感染： 这是最常见的途径。细菌（如大肠埃希菌等）从尿道口进入尿道，然后沿着尿道向上蔓延至膀胱、输尿管甚至肾脏。比如，不注意外阴部清洁卫生时，细菌就容易从尿道口侵入。女性在性生活后也容易发生上行感染，因为性生活可能会将细菌挤入尿道。血行感染： 较少见。身体其他部位的感染病灶中的细菌，通过血液循环到达尿道引起感染。例如，患有皮肤感染、肺炎等疾病时，细菌可通过血液传播到尿道。但这种情况相对少见，多发生在机体免疫力极度低下或有严重基础疾病的人群中。
机体自身因素影响
尿道局部因素： 尿道有梗阻时，如尿道结石、前列腺增生等，会影响尿液的正常排出，使尿液在尿道内停留时间延长，为细菌滋生提供了有利条件，从而增加急性尿道感染的发生风险。另外，尿道存在异物，像留置导尿管等，会破坏尿道的黏膜屏障，使细菌更容易侵入并引发感染。机体免疫力低下： 当人体免疫力下降时，比如患有糖尿病、长期使用免疫抑制剂、艾滋病患者等，身体抵御细菌的能力减弱，容易受到细菌侵袭而发生急性尿道感染。例如，糖尿病患者由于血糖偏高，有利于细菌生长繁殖，且自身免疫功能也会受到影响，所以比普通人更易发生尿道感染。
生活习惯相关因素
卫生习惯不佳： 不经常清洗外阴，尤其是女性，会阴部位容易滋生细菌，如果不及时清洁，细菌就会向尿道方向蔓延。另外，穿着紧身不透气的内裤，会使会阴部局部温度升高、湿度增大，为细菌繁殖创造了良好环境，增加急性尿道感染的发生几率。饮水过少： 喝水少会导致尿液生成减少，尿液对尿道的冲刷作用减弱，细菌就容易在尿道内停留、繁殖。一般建议每天至少饮用1500 - 2000毫升水，以保证充足的尿量来冲洗尿道，减少细菌感染的机会。如果长期饮水过少，就容易引发急性尿道感染。