癫痫是由多种原因引起的脑部神经元高度同步化异常放电所致的临床综合征，其引起的原因较为复杂，大致可从以下几方面来看。
遗传因素相关
特定基因变异： 大约有60%的癫痫与遗传因素有关。某些基因突变会影响神经元的正常功能，增加癫痫发作的风险。比如一些离子通道相关基因的突变，像钠离子通道基因、钾离子通道基因等发生突变时，就可能导致神经元的电生理特性改变，从而引发癫痫。据研究，家族性颞叶癫痫等某些遗传性癫痫综合征就与特定基因的遗传突变密切相关。家族遗传倾向： 如果家族中有癫痫患者，那么其他家族成员患癫痫的风险会比普通人群高。有数据显示，若家族中有一名癫痫患者，其亲属患病风险比一般人群高2 - 3倍；若有两名患者，风险可升至4 - 7倍。
脑部疾病相关
先天性脑发育异常： 胎儿在发育过程中，由于各种原因导致脑结构异常，如大脑半球畸形、灰质异位等。这些脑部结构的异常会使神经元的分布和连接出现问题，容易引发癫痫。例如，结节性硬化症是一种先天性脑发育异常疾病，患者脑部会出现多个结节样病变，常常会伴随癫痫发作。颅脑外伤： 头部受到严重撞击等外伤后，可能会导致癫痫。一般在颅脑外伤后的数月至数年可能会发生癫痫。据统计，中重度颅脑外伤后，癫痫的发生率约为20% - 50%。如果是开放性颅脑外伤，癫痫发生率会更高，可达30% - 50%。脑部肿瘤： 脑部的肿瘤会压迫周围脑组织，影响神经细胞的正常功能，进而引发癫痫。无论是良性肿瘤还是恶性肿瘤，都可能导致癫痫发作。例如，胶质瘤、脑膜瘤等常见脑部肿瘤都有引发癫痫的可能，尤其是生长在大脑皮质部位的肿瘤，更容易引起癫痫。
全身或系统性疾病相关
代谢紊乱： 像低血糖、低血钙等代谢紊乱情况都可能引发癫痫。低血糖时，大脑能量供应不足，神经元的正常功能受到影响，容易出现异常放电导致癫痫发作。一般血糖低于2.8mmol/L时，就可能引发低血糖性癫痫。低血钙时，神经肌肉兴奋性增高，也会导致神经元异常放电，儿童维生素D缺乏性手足搐搦症就常伴有低血钙性癫痫发作。感染性疾病： 中枢神经系统的感染，如脑炎、脑膜炎等。病原体感染脑组织后，会引起炎症反应，破坏脑组织的正常结构和功能，从而导致癫痫。例如，单纯疱疹病毒性脑炎患者，约有1/3会出现癫痫发作；结核性脑膜炎患者在病情恢复过程中，也可能出现癫痫发作。