胃肠型感冒通常由病毒感染引起，治疗药物主要有对症治疗药物等。一般来说，可通过使用缓解症状的药物来改善不适。
对症治疗药物
缓解感冒症状类：常用的有复方氨酚烷胺胶囊等，它能缓解胃肠型感冒引起的发热、头痛、鼻塞、流涕等症状。不过，这类药物可能会引起轻度头晕、乏力、恶心等不良反应，一般停药后可缓解。止吐类：如果胃肠型感冒患者有明显呕吐症状，可使用多潘立酮片。它能促进胃肠蠕动，缓解呕吐情况，但孕妇及哺乳期妇女应慎用，低龄儿童使用需谨慎，需在医生指导下根据体重等情况使用。止泻类：对于出现腹泻症状的胃肠型感冒患者，蒙脱石散比较常用。它可以吸附肠道内的病原体和毒素，起到止泻作用。儿童服用时要注意按照合适的剂量服用，将蒙脱石散用适量温水溶解后服用。
抗病毒类药物
常用抗病毒药物：如果是由流感病毒等引起的胃肠型感冒，在发病早期可考虑使用奥司他韦。奥司他韦能抑制流感病毒的神经氨酸酶活性，阻止病毒从被感染的细胞中释放，从而减少病毒的传播。但奥司他韦也有一些注意事项，比如对奥司他韦过敏者禁用，而且它可能会引起恶心、呕吐等胃肠道不适反应，一般建议在医生的指导下，根据患者的具体病情来决定是否使用以及使用的疗程等。
调节肠道菌群类药物
常用药物：当胃肠型感冒影响肠道菌群时，可使用双歧杆菌四联活菌片等调节肠道菌群的药物。这类药物可以补充肠道有益菌，抑制有害菌的生长，有助于恢复肠道正常的菌群平衡，改善腹泻、腹胀等肠道不适症状。不过，服用这类药物时要注意不能用过热的水送服，以免影响药物活性。儿童使用时要按照儿童的剂量来服用，并且要在医生或药师的指导下使用。