小孩肛门疼痛可能由多种原因引起。比如，常见的有肛裂，多因小孩大便干结，排便时撑裂肛管皮肤导致，这种情况在排便后疼痛较为明显，有时还会伴有便血。
一、肛周感染相关
肛周脓肿： 多是细菌感染引起，小孩肛门周围会出现红肿、疼痛，而且肿块有波动感，一般在1 - 2天内可能会逐渐增大，孩子会因为疼痛而哭闹不安。这种情况需要及时就医，可能需要抗感染治疗甚至手术引流。肛窦炎： 肛窦受细菌感染引发炎症，小孩会感觉肛门内有坠胀感，排便时疼痛加重，有时还会有少量黏液从肛门流出。
二、寄生虫感染因素
蛲虫感染： 多见于夜间，蛲虫会爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，导致肛门剧烈瘙痒，进而引起疼痛，孩子可能会因为瘙痒和疼痛而睡眠不安。可以在夜间孩子入睡后检查肛周，能发现白色细小的蛲虫。
三、局部皮肤问题
尿布皮炎： 如果小孩长时间使用不透气的尿布，或者尿布更换不及时，肛周皮肤会受到尿液、粪便的刺激，出现发红、疼痛，严重时会有皮疹、溃烂等情况。此时要注意保持肛周皮肤清洁干燥，及时更换尿布。湿疹： 肛周皮肤也可能发生湿疹，表现为肛周皮肤红斑、丘疹、水疱，伴有瘙痒和疼痛，孩子会不自觉地搔抓肛周，加重症状。