萎缩性胃炎伴中度肠化生的治疗方法如下：
1.一般治疗：
戒烟戒酒，减少对胃黏膜的刺激。
饮食应规律，避免过热、过咸和辛辣食物。
避免长期服用非甾体抗炎药，如阿司匹林等。
2.药物治疗：
胃黏膜保护剂：如硫糖铝、枸橼酸铋钾等，可保护胃黏膜，促进炎症愈合。
胃酸抑制剂：如奥美拉唑、兰索拉唑等，可减少胃酸分泌，缓解症状。
消化酶制剂：如多酶片、胰酶片等，可帮助消化，改善消化不良症状。
维生素B12：如果伴有维生素B12缺乏，可补充维生素B12。
3.根除幽门螺杆菌感染：如果幽门螺杆菌感染阳性，需进行根除治疗。常用的四联疗法包括质子泵抑制剂、铋剂、两种抗生素。
4.手术治疗：
对于重度不典型增生或局部癌变的患者，可能需要手术治疗。
5.定期复查：萎缩性胃炎伴中度肠化生有癌变的风险，需要定期复查胃镜和病理检查，以便及时发现和处理病变。
需要注意的是，具体的治疗方案应根据患者的具体情况制定，如年龄、症状、合并疾病等。在治疗过程中，患者应积极配合医生的治疗，同时注意饮食和生活习惯的调整。如果有任何疑问或不适，应及时就医。