肛周脓肿主要通过手术和药物等方法治疗，手术是根治的关键，一般确诊后若有手术指征通常需尽快手术。
手术治疗方式
切开引流术：这是治疗肛周脓肿最常用的方法。医生会在脓肿波动最明显的部位切开，排出脓液。一般在局部麻醉下就可进行，术后需要定期换药，促进伤口愈合，这个过程可能需要几周时间。一次性根治术：对于部分简单的肛周脓肿，可采用一次性根治术。这种手术能一次彻底解决问题，避免形成肛瘘。但手术对医生的技术要求较高，需要准确找到内口并处理。
药物辅助治疗
抗生素治疗：在手术前后可能会使用抗生素来控制感染。常用的有头孢类抗生素等。一般会根据脓肿的严重程度和患者的情况来选择合适的抗生素，可能需要静脉给药或口服。比如对于较为严重的肛周脓肿，可能先通过静脉输入头孢曲松等抗生素来迅速控制炎症。止痛药：如果肛周脓肿引起疼痛较明显，会使用止痛药来缓解症状。像布洛芬等非甾体类抗炎止痛药可以在一定程度上减轻疼痛，但要注意按照医生的指导使用，避免不良反应。
术后护理要点
伤口换药：术后伤口换药非常重要，一般需要每天或隔天进行。换药时要清理伤口内的分泌物等，促进伤口从里向外愈合。换药过程可能会有一定的疼痛感，但必须按时进行。饮食注意：患者术后要注意饮食，多吃富含纤维素的食物，如蔬菜、水果等，保持大便通畅，避免大便干结对伤口造成刺激。一般建议每天保证摄入足够的蔬菜，如菠菜、芹菜等，水果可以选择香蕉等。同时要避免吃辛辣刺激性食物，如辣椒、花椒等，以免加重局部充血，影响伤口恢复。保持肛周清洁：要注意保持肛周的清洁卫生，每次排便后最好用温水清洗肛周，可使用坐浴的方法，如用温水或中药坐浴，每天1 - 2次，每次15 - 20分钟，这样有助于保持伤口清洁，促进愈合。