龟头炎的治疗药物需根据病因选择，一般细菌感染引起的龟头炎，常用莫匹罗星软膏等抗生素类药物；念珠菌感染引起的，可使用克霉唑乳膏等抗真菌药物。通常来说，及时规范用药能较好改善症状，但具体用药需遵医嘱。
细菌感染性龟头炎用药
莫匹罗星软膏： 属于局部外用抗生素，适用于革兰阳性球菌引起的皮肤感染。它能抑制细菌蛋白质的合成，从而发挥抗菌作用，可用于细菌感染导致的龟头炎，局部涂抹即可。夫西地酸乳膏： 对引起龟头炎的常见细菌有较好的抗菌活性，通过抑制细菌的蛋白质合成来杀灭细菌，帮助缓解细菌感染引发的龟头红肿、疼痛等症状。
念珠菌性龟头炎用药
克霉唑乳膏： 是抗真菌药物，能抑制真菌细胞膜的合成，影响其代谢过程，对念珠菌有较好的抑制和杀灭作用，可用于念珠菌感染引起的龟头炎，涂抹在患处能减轻局部的瘙痒、红斑等症状。硝酸咪康唑乳膏： 同样是抗真菌药，通过干扰真菌细胞的合成来发挥作用，适用于念珠菌等真菌感染导致的龟头炎，使用时均匀涂抹于患处。
其他类型龟头炎用药
滴虫性龟头炎： 可使用甲硝唑治疗，不过一般是口服配合局部用药。口服甲硝唑能抑制滴虫的氧化还原反应，使原虫氮链发生断裂，从而发挥抗滴虫作用。但要注意，孕妇及哺乳期妇女禁用甲硝唑，需在医生指导下谨慎使用。浆细胞性龟头炎： 可能需要使用糖皮质激素类药物，如氢化可的松乳膏等，但这类药物使用需谨慎，要根据病情在医生评估后合理应用，因为长期或不当使用可能会有一些不良反应。同时，要注意保持局部清洁卫生，避免刺激因素，如避免搔抓、热水烫洗等。